这里属大陆性气候，天气变化无常，有时一日数变，风雪冰雹交替降临。据实测，每年4月底以前为狂风大雪主宰，6月初以后至8月末以前，则阴雨连绵，雪雹齐全，时而还伴有龙卷风，日降水量l0毫米左右的情形往往持续20天以上。

　  一年中最低气温为1月份，峰顶气温可达一50℃以下。而每年4月底至6月初和9月、10月两月，主峰最低气温为一30℃。全年以西北风和东北风最盛，西风也较多。2、3、4月风最大，又以3月为最。

　  风速在17米／秒以上的大风常常连续15天以上。海拔4700米的地方最大风速可达40米／秒。阿尼玛卿山区属大陆兴气候，天气变化无常，有时一日数变，每年4月底以前狂风大雪肆虐，6月底以后至8月末以前，则阴雨连绵，雪雹不断。因此最佳登山时间是4月底至6月初或9月至10月。最佳旅游登山时间是6月至9月。